fastGEN Crohn's & Celiac Disease Kit

Identifikace genetických faktorů spojených s predispozicí ke Crohnově chorobě a celiakii přispívá k lepšímu porozumění genetickému pozadí těchto komplexních multifaktoriálních onemocnění. Vybrané genetické varianty a haplotypy jsou asociovány s predispozicí k těmto onemocněním a představují významné markery pro cílenou genetickou analýzu.

fastGEN Crohn’s & Celiac Disease Kit umožňuje v rámci jednoho cíleného NGS řešení genotypizaci vybraných oblastí asociovaných s haplotypy HLA-DQ2 a HLA-DQ8, které souvisejí s predispozicí k celiakii, společně s analýzou vybraných variant v genech IL23R a NOD2, asociovaných s predispozicí ke Crohnově chorobě. Řešení využívá technologii krátkých amplikonů získaných pomocí jediné PCR s tagovanými hybridními primery.

Ready-to-use Master Mixy zjednodušují přípravu sekvenační knihovny a snižují počet manuálních kroků. Pro přípravu knihovny stačí přidat izolovanou DNA do příslušného Master Mixu a provést amplifikaci na real-time PCR termocykleru.

Součástí komplexního řešení je cloudový software GENOVESA, modul fastGEN, určený pro automatizovanou bioinformatickou analýzu NGS dat. Software nabízí pokročilou kontrolu kvality sekvenačních dat, jednoduchou filtraci variant, vizualizaci NGS dat a přehledné zpracování výsledků.

Klíčové benefity fastGEN technologie

• jednoduchá a efektivní technologie cíleného NGS
• jednokroková PCR příprava sekvenační knihovny
• ready-to-use Master Mixy pro zjednodušení workflow
• vstupním materiálem je izolovaná DNA; kit je validován pro DNA izolovanou z bukálního stěru a periferní krve
• analýza vybraných oblastí asociovaných s HLA-DQ2 a HLA-DQ8 a variant v genech IL23R a NOD2 v rámci jednoho řešení
• robustní technologie založená na krátkých amplikonech
• automatizovaná analýza dat pomocí GENOVESA modulu fastGEN.